Михаэль Бауэр родился в Мюнхене, с 1980 года работает в Баварской государственной опере, куда сначала пришел в качестве стажера; с 1998 года – главный художник по свету. С 1993 года преподает театрально-сценическое освещение в мюнхенской Высшей школе музыки. Среди работ Бауэра в Баварской опере – спектакли «Тоска», «Дон Карлос», «Летучая мышь», «Любовный напиток», «Тристан и Изольда», «Енуфа», «Волшебная флейта», «Летучий голландец», «Борис Годунов», «Медея», «Борис Годунов», «Вильгельм Телль», «Арабелла» и другие. Сотрудничает с театрами Гамбурга, Парижа, Мадрида, Сан Франциско, Нью-Йорка, Милана, Антверпена, Базеля, Женевы, Афин, Санкт-Петербурга. Создал световое оформление спектаклей Янниса Коккоса «Набукко», «Летучий Голландец» и «Отелло».