Вадим Бондаренко родился в Ленинграде. В 1996 году окончил Санкт-Петербургскую консерваторию (класс Павла Суханова, Андрея Казакова), с того же года работает в оркестре Мариинского театра, в настоящее время – солист группы кларнетов.
В Мариинском театре помимо работы в оркестре исполняет сольный и ансамблевый репертуар в Концертном и камерных залах, вместе с другими кларнетистами оркестра был участником ансамбля «Мариинский кларнет клуб». В трио с Марией Федотовой (флейта) и Владимиром Волковым (контрабас) играет в Санкт-Петербургской филармонии, на новой сцене Александринского театра, в зале «Зарядье» (Москва) и на других концертных площадках. Также выступает как пианист.
Как композитор работает в различных жанрах – классические, электроакустические, этнические композиции, эмбиент, нью-эйдж, импровизации. Музыка Вадима Бондаренко выпущена на компакт-дисках (альбомы Sentimental, Quiet Songs From Misty Places, Cloudscapes и другие), на которых большую часть композиций он исполняет сам.