Маргарита Майстрова окончила Среднюю специальную музыкальную школу при Ленинградской консерватории и консерваторию (1980) по классу Александры Вавилиной. В 1980–1986 – солистка симфонического оркестра Ленинградской консерватории, приглашенный музыкант Заслуженного коллектива Республики – симфонического оркестра Ленинградской филармонии под управлением Евгения Мравинского. С 1986 года – артистка оркестра Кировского (Мариинского) театра (флейта-пикколо). Участвовала в записях на лейбле Mariinsky (Симфония № 2 Шостаковича, «Дон Кихот» Массне).